2020年12月14日上午9:30,由彭友松副教授主持的第105期天馬學術論壇在生物學院B111教室舉行,美國馬裡蘭大學醫學院張鵬教授應邀來我院生物信息中心進行學術交流,并做題為“免疫細胞圖譜計劃”的精彩學術報告。

此次講座内容主要圍繞“免疫細胞圖譜計劃”為主題展開,介紹了以下三點内容:首先,利用單細胞轉錄組測序,免疫組庫TCR\BCR測序,以及質譜成像(Mass Spectrometry Imaging)等技術來研究腫瘤微環境,特别是浸潤腫瘤免疫細胞的功能狀态和空間組成,構建免疫細胞基因表達和等高維數學特性的精細圖譜。第二,将數據挖掘和機器學習算法應用到癌症免疫組學大數據中,以揭示癌症的亞型、驅動基因以及其他緻癌因素的遺傳基礎,并整合藥物作用下免疫環境異質性對癌細胞的功能和藥敏的影響,從而發現新型癌症靶點和免疫治療标記物。第三,開發原創性的生物信息學工具和整合性的醫學數據平台來進行單細胞基因組數據和大規模癌症基因組學數據的分析、整合和可視化,為對這些數據的有效挖掘提供基礎。

張鵬教授的演講深入淺出,對新概念的解釋簡潔到位,實驗流程邏輯清晰,讓同學們即使在不同的領域也能輕松理解他們的研究内容。演講後各位老師同學們也積極提出自己的疑惑,并進行了相關的經驗交流,學術氛圍濃厚,無論演講人還是與會的老師和同學都頗有收獲。
報告人簡介:
張鵬博士,現任美國馬裡蘭大學醫學院助理教授,生物信息課題負責人,人類病毒研究所生物信息平台主任。張鵬博士2015年畢業于中國科學院生物物理研究所,獲得生物信息學博士學位。同年任職于美國國家兒童醫學中心,從事博士後研究所工作。2018年在馬裡蘭大學醫學院人類病毒研究所擔任副研究員,2020年起開展獨立課題工作,任助理教授和生物信息平台主任。張鵬課題組緻力于整合測序技術,醫學影像技術,以及生物信息和機器學習算法,開展“免疫細胞圖譜計劃"(Single Cell Atlas of Immunity)以及 “智能醫療影像診斷”(AI in Medical Imaging)等科研項目.相關研究成果發表于Nature, Nature Material, Cell Research, Cancer Research, Briefings in Bioinformatics等國際權威雜志并申請美國專利多項。擔任IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine會議學術委員會成員,以及PNAS,Briefings in Bioinformatics Oncoimmunology Journal of Molecular Cell Biology等雜志審稿人。
圖文: 彭友松